Clinical data analysis
Skill palmiro72-coder/palmiros-claude/plugins/palmiros-clinical-br/skills/clinical-data-analysis
Marketplace de plugins do Claude Code — 14 skills agrupadas em 5 plugins: operações clínicas BR (endo + derm), revenue cycle US, pesquisa científica (harmonia sexagesimal + patentes + mineração), criação visual via Gemini e SecOps/infra.
npx -y skills add palmiro72-coder/palmiros-claude --skill clinical-data-analysisAssembled from the repository path, not quoted from the project. Check it against their README if it does not work.
One thing to look at
- 0 stars0 stars. Stars are a popularity signal and not a quality one, but at this level it is likely that nobody has read this closely except its author, and you would be relying on your own review.
What its author says it does
Copied from the file, not written here
Analisa dados clínicos, laboratoriais e de pesquisa para endocrinologia. Processa CSV, Excel, bioimpedância. Gera sumários estatísticos e visualizações.
SKILL.md
5.3 KB, as published. Nobody here has run it
Clinical Data Analysis — Skill de Análise de Dados Clínicos
Análise estatística e visualização de dados para prática clínica endocrinológica e pesquisa acadêmica.
Capacidades
1. Análise de Dados de Pacientes
- Evolução temporal de parâmetros (peso, IMC, circunferências, labs)
- Análise de composição corporal (bioimpedância seriada)
- Correlações entre variáveis clínicas e laboratoriais
- Estratificação de risco metabólico
- Curvas de resposta terapêutica
2. Estatística para Pesquisa
- Teste t, Mann-Whitney, Wilcoxon
- ANOVA / Kruskal-Wallis
- Regressão linear e logística
- Curvas ROC e AUC
- Análise de sobrevida (Kaplan-Meier)
- Tamanho amostral e poder estatístico
- Meta-análise (forest plots, funnel plots)
3. Validação de IA Médica
- Sensibilidade, especificidade, VPP, VPN
- Matrizes de confusão
- Curvas ROC para modelos de classificação
- Validação cruzada k-fold
- Concordância inter-observador (Kappa de Cohen)
- Bland-Altman plots
- Calibração de modelos (Hosmer-Lemeshow)
4. Dashboards Clínicos
- Perfil de pacientes por diagnóstico
- Distribuição de comorbidades
- Tempo médio de espera / follow-up
- Indicadores de qualidade assistencial
- Análise financeira da clínica
Parâmetros Endocrinológicos Comuns
Perfil Tireoidiano
| Exame | Unidade | Referência | Notas |
|---|---|---|---|
| TSH | mUI/L | 0.4 - 4.0 | Ultrassensível |
| T4 Livre | ng/dL | 0.7 - 1.8 | |
| T3 Total | ng/dL | 80 - 200 | |
| Anti-TPO | UI/mL | < 35 | Autoimunidade |
| Anti-Tg | UI/mL | < 115 | |
| Tireoglobulina | ng/mL | < 77 | Seguimento ca tireoide |
Perfil Metabólico
| Exame | Unidade | Referência |
|---|---|---|
| Glicemia jejum | mg/dL | 70 - 99 |
| HbA1c | % | < 5.7 (normal), < 7.0 (DM controlado) |
| Insulina basal | µUI/mL | 2.6 - 24.9 |
| HOMA-IR | - | < 2.71 |
| Colesterol total | mg/dL | < 190 |
| LDL | mg/dL | Conforme risco CV |
| HDL | mg/dL | > 40 (H), > 50 (M) |
| Triglicérides | mg/dL | < 150 |
Perfil Hormonal
| Exame | Unidade | Notas |
|---|---|---|
| Cortisol 8h | µg/dL | 6.2 - 19.4 |
| ACTH | pg/mL | 7.2 - 63.3 |
| IGF-1 | ng/mL | Ajustar por idade |
| GH basal | ng/mL | < 3.0 |
| Testosterona total | ng/dL | 249-836 (H) |
| Estradiol | pg/mL | Conforme fase do ciclo |
| PTH | pg/mL | 15 - 65 |
| 25-OH Vitamina D | ng/mL | 30 - 60 (suficiente) |
| Cálcio iônico | mmol/L | 1.12 - 1.32 |
Ferramentas Estatísticas
Python (preferido)
# Bibliotecas core
import pandas as pd
import numpy as np
import scipy.stats as stats
import matplotlib.pyplot as plt
import seaborn as sns
from sklearn.metrics import roc_curve, auc, confusion_matrix
import statsmodels.api as sm
Visualizações Padrão
- Evolução temporal: Line plot com IC 95%
- Distribuição: Histogramas com KDE overlay
- Correlação: Scatter plots com regressão + r²
- Comparação de grupos: Box plots / Violin plots
- ROC: Curva com AUC e IC bootstrap
- Forest plot: Para meta-análises
- Waterfall plot: Para variação individual
Formatação de Gráficos Clínicos
# Paleta médica padrão
COLORS = {
'normal': '#2ecc71',
'borderline': '#f39c12',
'alterado': '#e74c3c',
'referencia': '#95a5a6',
'primary': '#3498db',
'secondary': '#9b59b6'
}
# Estilo padrão
plt.style.use('seaborn-v0_8-whitegrid')
plt.rcParams['font.family'] = 'sans-serif'
plt.rcParams['font.size'] = 11
plt.rcParams['figure.dpi'] = 150
Validação de IA Dermatológica (Pesquisa Doutoral)
Métricas Obrigatórias
- Acurácia global e por classe
- Sensibilidade/Especificidade por lesão
- Curva ROC multiclasse (one-vs-rest)
- Matriz de confusão normalizada
- Concordância IA vs dermatologista (Kappa ponderado)
- Calibração (reliability diagram)
Framework de Validação
DATASET
├── Treino (70%)
├── Validação (15%)
└── Teste (15%) — nunca tocado até avaliação final
AVALIAÇÃO
├── Validação cruzada 5-fold no treino
├── Métricas no conjunto de teste
├── Comparação com dermatologistas (ground truth)
└── Análise de subgrupos (fototipo, localização, tamanho)
Fluxo de Análise
- Receber dados (CSV, XLSX, ou entrada manual)
- Validar integridade e qualidade dos dados
- Explorar estatística descritiva e distribuições
- Analisar conforme objetivo (comparação, correlação, predição)
- Visualizar com gráficos publicação-ready
- Gerar relatório com interpretação clínica
- Exportar em formato solicitado (xlsx, pdf, png)
Exemplos de Uso
- "Analise a evolução de TSH destes 50 pacientes ao longo de 12 meses"
- "Calcule o HOMA-IR e estratifique o risco metabólico desta coorte"
- "Gere uma curva ROC para o modelo de classificação de lesões dermatológicas"
- "Compare os resultados de perda de peso entre semaglutida e tirzepatida neste dataset"
- "Monte um dashboard dos KPIs da clínica no último trimestre"
- "Faça a análise estatística para o artigo sobre validação de IA dermatológica"