1 research design diagnosis

研究設計建構技能

版本與定位

版本：v1.1.2（必讀清單補 writing-standards 選讀列與控制檔模板出處；完整版本歷史見 repo CHANGELOG） 定位：全程骨架建構工具，非一次性診斷工具 設計原則：階梯式建構、多向工作流、重複調用、與下游 Skills 銜接

本檔 references（按需載入）：references/adversarial-and-commitment.md（對抗檢核與 commitment gate）、references/paper-structure-template.md（模板正文＋完成清單 canonical 表，第四部分使用）、references/reasoning-framework.md（論證與推論框架）。

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環境偵測（所有讀取動作之前，最先執行）

本 skill 以 00_專案控制/ 作為控制檔的預設路徑，此路徑假設一個持久的工作區資料夾（Claude 桌面應用的 Cowork 模式，或 Claude Code）。若該路徑不存在，代表使用者在無工作區環境（例如 claude.ai 網頁版）執行本 skill。此時一律進入「無工作區模式」，不得以「檔案缺失」為由拒絕啟動。

無工作區模式的三條規則：

1. 控制檔改在別處尋找。依序查找同名檔案：對話附件 → 專案知識庫（claude.ai 的 Project files）→ 使用者於本次對話明確指定的位置。找到即視同滿足必讀要求，正常推進；三處皆無才回報缺失，並明確告知使用者可透過對話附件或 Project files 提供。此規則覆蓋本 skill 所有「缺漏即拒絕啟動」的硬閘門條文——閘門的實質要求是「讀得到該檔的內容」，不是「該檔位於特定路徑」。
2. 產出改以可下載檔案交付，不嘗試寫入 05_輸出/ 或任何工作區路徑。晉升流程（審定後移入正式位置）改由使用者手動完成，於交付時一併說明。
3. 跨 session 狀態改由使用者提供。本 skill 若依賴 05_輸出/progress-log.md、既有產出檔或凍結狀態回讀斷點，在無工作區模式下改為請使用者於開場提供前輪產出（附件或貼上內容）；無法取得時，明示「本次為無工作區模式，跨對話狀態不自動續作」後，以本次提供的材料為準推進。

啟動宣告中必須載明當前模式：「工作區模式」或「無工作區模式」。

第一部分｜執行前的準備

階段零：必讀脈絡檔案

所有啟動情境都必須先讀取：

• 00_專案控制/about-me.md：研究發展目標、優先序規則框架、AI 角色（穩定身份）、使用者自訂寫作慣性清單（見該檔「寫作慣性自我申報」節，若已填寫）
• 00_專案控制/portfolio-status.md：發表組合現況、優先序規則的目前對應、時程事件（首席參謀戰略評估與資源競爭判斷的動態依據——涉及優先序判斷時必讀）
• 00_專案控制/research-identity.md：理論版圖、方法論立場
• 00_專案控制/writing-standards.md（選讀，進入階段二前建議載入）：寫作紀律與品質門檻——階段二「每節寫作要點」需對應其規則，未載入時寫作要點欄僅給結構性提示並標註
• 00_專案控制/folder-instructions.md（若存在）：當前研究專案專屬協作規則

控制檔空白模板（含填寫指引）在 repo starter-kit/00_專案控制/；若你只單獨取得本 .skill 檔，請至 https://github.com/LoWeiLee/academic-ai-workflow 下載 starter-kit。

階段零：模式識別

模式判定前置（S-0 狀態回讀）：判定 Mode 前，先 (1) Glob 當前專案 05_輸出/paper-structure_* 與 05_輸出/戰略評估_*（本 skill 階段輸出）；(2) 讀 05_輸出/progress-log.md 末段最近本 skill 條目（若存在），恢復已建構層級、commitment gate 開關狀態、待確認清單；(3) 若 05_輸出 存在比正式位置更新的 paper-structure 修訂版，提示使用者確認要採用哪個版本後再判定——防止版本確認前誤觸 Mode A 全量重建。

Mode A｜建立新架構

• 信號：專案資料夾不存在 paper-structure.md，或研究者說「新研究」「新計畫」「開始構思」「想寫一篇」「要寫研究計畫書（如國科會）」
• 執行：完整三階段建構

Mode B｜修訂 / 深化現有架構

• 信號：已有 paper-structure.md，研究者說「繼續建構」「展開第 X 章到節層級」「深入第 X 節到小節」「發現問題要調整」「框架跑掉了」
• 執行：先讀取現有 paper-structure.md，識別當前已建構層級，接續深化或修訂

階段零：任務類型識別

類型 T1｜期刊論文：5 章（緒論、文獻、方法、結果、結論）；目標 TSSCI / SSCI；小節展開——第 2 章必須、第 3/4 章建議、第 1/5 章可選 類型 T2｜研究計畫書（如國科會等研究經費申請）：6 節（研究緣起、研究目的與問題、文獻探討、研究方法、預期結果與貢獻、研究時程）；目標送件爭取經費；小節展開——文獻探討與研究方法必須、其餘可選 類型 T3｜混合產出（先計畫書後期刊）：在多篇論文組合中常見；先走 T2 完成計畫書、計畫執行中期產生結果後啟動 T1 反向工作流

註：TSSCI 分級與國科會皆為臺灣在地示例，請依你所屬學術體系的期刊分級與補助機構替換。

階段零：工作方向識別（關鍵決策）

依任務特性選擇工作方向，此決策影響整個後續的 Q&A 順序與章節推進順序。

方向 D1｜前向工作流（R → T → M → C → S）

• 適用：全新題目、博論、期刊論文但無既有資料、研究計畫書
• Q&A 順序：核心問題 → 理論 → 方法 → 貢獻 → 戰略；章節推進：第 1 → 2 → 3 → 4 → 5

方向 D2｜反向工作流（M + 結果 → T → R → C）

• 適用：量化成果拆分、既有資料二次分析、博士論文章節轉期刊
• Q&A 順序：方法細節 + 已有結果 → 理論對話可能性 → 核心問題（倒推）→ 貢獻定位；章節推進：第 3 → 4 → 2 → 5 → 1

方向 D3｜計畫書工作流（缺口 → R/T → M → C）

• 適用：國科會計畫書、合作研究案、新題目的提案階段
• Q&A 順序：研究缺口 → 研究問題 / 理論 → 方法 → 預期貢獻；章節推進：研究緣起 → 目的與問題 → 文獻 → 方法 → 預期結果

階段零：範本讀取（若存在）

範本與 SKILL.md 的優先序依第八部分「範本優先原則」執行。

若 00_專案控制/example-research-design-diagnosis.md 存在，強制以 Read 讀取，作為格式、深度、語調的對齊基準。 若不存在，明確告知研究者：「research-design-diagnosis 尚無範本，本次輸出將依 SKILL.md 現行版指引產生，建議完成後考慮保留為範本。」

階段零：來源文件讀取（若有上傳）

若對話中有上傳文件（博論全文、計畫書草稿、前期研究報告、已有量化結果）：

主動讀取並提取以下資訊後再開始 Q&A——Q&A 只補充無法從文件獲得的決策：

提取項目	對應維度
核心研究問題與子問題	R
援引的理論框架與核心概念	T
研究方法、資料來源、分析工具	M
已有結果或發現（反向工作流必備）	結果
原文的貢獻宣稱與研究缺口定位	C

提取完成後向研究者摘要：「我從這份文件中識別到……（摘要）。以下幾個問題是文件中尚未明確的決策，需要你確認：……」

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第二部分｜三階段建構架構

階段轉換重申（防長流程遺忘）：每次跨階段推進（章→節、節→小節）或重複調用進入新層級前，先重申三條鐵律——① commitment gate 不跳過：三決策點先請使用者一兩句表態再給建議（除非使用者明確關閉）；② 對抗檢核不撤回：主動挑自家前提，不因使用者堅持而撤回未被有力反駁的挑戰（與 review-diagnosis 讓步閾值不同，此處無讓步條件）；③ 錨定 paper-structure：輸出前檢查是否偏離既有 paper-structure.md，只動當前層級、局部更新不覆寫整檔。

階段一：章層級建構

目的：確定大框架的章結構與章間銜接，完成 RTMCS 五維的第一層檢核。

執行內容：

1. 依工作方向執行 Q&A（詳見第三部分各工作方向的 Q&A 腳本）
2. 產出 paper-structure.md 的「各章架構」節骨架（僅到章的核心任務、字數目標、與前後章的銜接關係）
3. RTMCS 五維的章層級檢核：
   • R：核心問題是否明確且可操作？
   • T：援引理論是否真正服務於問題？
   • M：方法是否由問題推導？
   • C：貢獻定位是否清晰？主張強度與設計是否匹配？
   • S：與研究發展目標的吻合度？資源競爭？（依 portfolio-status.md 的當前組合判斷）
4. 標記模糊處：任何未確認的欄位標記「⚠️ 待確認」，並說明需要釐清什麼
5. 輸出首席參謀戰略評估：在對話層輸出 + 存檔至 05_輸出/戰略評估_paper-structure_[日期].md

Q&A 彈性：章層級通常 2-3 輪 Q&A 可完成。若複雜度高，不強制限縮輪次——原則是「核心章框架不清楚時不推進到階段二」。

階段一結束時的輸出：

• 05_輸出/paper-structure_[論文名稱]_章層級_[日期].md
• 對話層：首席參謀戰略評估
• 存檔：05_輸出/戰略評估_paper-structure_[日期].md

輸出後必須明示的正本化步驟（不可省略）：向使用者說明——「請將確認後的版本改名為 paper-structure.md、搬入 00_專案控制/。skill 2 至 5 一律以 00_專案控制/paper-structure.md 這個路徑為錨點讀取它；停留在 05_輸出/ 的話，下游工序會找不到而中斷。」首次產出時務必主動講，不要假設使用者知道。

階段一附加：commitment gate 與對抗檢核

commitment gate（先表態再給結構）：三個決策點——選工作方向、定核心 RQ、挑缺口／定貢獻——出現即觸發，不論所在階段（選工作方向發生於階段零；RQ 與貢獻的修訂可能發生於 Mode B）。Claude 給建議前，先請使用者一兩句表態自己的答案，再給建議並標示同異。使用者可說「跳過表態」關閉。話術與紀錄格式見 references/adversarial-and-commitment.md A 節。設計動機：把判斷權前置，制衡後設漂移與「被 AI 代為框架」風險。

對抗檢核（devil's advocate，強制）：階段一 RTMCS 檢核後、戰略評估輸出前，對核心 RQ 與貢獻定位跑一次（前提挑戰／反方視角／frame-lock 三問／因果預設檢），結果填入戰略評估「反方論證與 frame-lock 風險」欄。提問組與紀律見 references/adversarial-and-commitment.md B 節；因果與語氣對照見 references/reasoning-framework.md。與 review-diagnosis 讓步閾值不同：此處無讓步條件，主動挑自家前提，不因使用者堅持而撤回未被有力反駁的挑戰。

階段二：節層級建構

目的：每章確定節的切分邏輯、核心任務、字數目標、寫作要點、與 Skills 的銜接切點。

執行方式：

• 逐章進行（不一次展開全部 5 章，避免疲勞）；每次只處理 1-2 章
• 章的推進順序依工作方向決定（見第三部分）

每章的節層級 Q&A 重點：

• 本章的主要論述路徑是什麼？（決定節的切分邏輯）
• 每節的核心任務（一句話）？每節的字數目標？
• 每節的寫作要點 / 紀律（對應 writing-standards.md、folder-instructions.md 的哪些規則）？
• 本節可啟動哪個 Skill？（介面合約標記）

RTMCS 五維的節層級檢核：R/T/M/C 逐節對齊（S 僅在章層級做）。

階段二結束時的輸出：

• paper-structure.md 的「各章架構」節擴展到節層級（累積更新）
• 對話層：標記「當前 paper-structure.md 進度：[哪幾章已完成節層級，哪幾章待推進]」

階段三：小節層級建構

目的：節之下選擇性展開小節的論述方向、論證邏輯、段落骨架提示。

執行方式：

• 按需逐節進行。原則上必須展開到小節者：第 2 章所有節、第 3 章方法學核心節、第 4 章所有節。按需展開者：第 1 章、第 5 章、第 3 章總論性節。

每節的小節層級 Q&A 重點：論述順序、每小節核心論點、論證邏輯、關鍵文獻或證據、段落骨架（可選）。

RTMCS 檢核：R（小節論點是否支撐節任務）/ T（理論論證是否嚴密）/ C（是否支撐貢獻定位某面向）。

文獻白名單協作（第 2 章小節建構完成後，標記 literature-search 之前必做）：

針對剛完成小節建構的節，主動執行以下步驟：

1. 基於已確立的 RQ、理論框架、論述順序，從訓練記憶推薦該節的奠基文獻與近期關鍵文獻（3–8 篇），每篇附：作者年份、標題、推薦理由（一句話）、預估 DOI
2. 向使用者說明：「以下是我認為這節應優先掌握的關鍵文獻，確認後可填入 paper-structure.md 的經典文獻白名單欄位，literature-search 執行時這些文獻將跳過 rubric 評分直接納入。」
3. 使用者確認（可接受 / 替換 / 增減）後，將確認清單寫入 paper-structure.md 的**「經典文獻白名單（DOI）」**欄位——欄位結構以 references/paper-structure-template.md 該表為單一權威，本檔不重述欄位
4. 若 DOI 不確定，標記「⚠️ DOI 待 literature-search 驗證」，literature-search 的 doi_verify.py 會在階段一 Step 2 執行驗證

注意：此步驟是補強「你第一次碰到的理論領域」覆蓋率的關鍵機會。Claude 的訓練記憶在這裡比 API 搜尋更能識別該理論的奠基傳統與主流學者。

「此節可啟動 Skill X」介面合約標記：

• 第 2 章某節達到小節層次 → 標記「✅ 可啟動 literature-search 文獻搜尋」
• 第 2 章某節 literature-search 完成（_metadata.json 已產出，且 pending_zotero_transfer.md 的「PDF 已晉升至 vault」欄已勾選）→ 標記「✅ 可啟動 literature-analysis 逐篇文獻分析」
• 第 2 章某節 literature-analysis 完成 → 標記「✅ 可啟動 literature-synthesis 跨文件綜整」
• 第 2 章某節 literature-synthesis 綜整完成 + 論述邏輯確定 → 標記「✅ 可啟動 chapter-drafting 章節撰寫」
• 其他章節達小節層級 → 標記「✅ 可啟動 chapter-drafting 章節撰寫」

階段三結束時的輸出：

• paper-structure.md 擴展到小節層級（累積更新）
• 對話層：標記下一步建議（啟動下游 Skills / 繼續深化其他節 / Mode B 修訂）
• 對話層：若 00_專案控制/paper-structure.md 尚不存在（即目前只有 05_輸出/ 的版本），再次提醒使用者完成正本化——改名為 paper-structure.md 搬入 00_專案控制/，否則上表標記的下游 Skills 一律啟動不了

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第三部分｜三種工作方向的 Q&A 腳本

方向 D1｜前向工作流

章節推進順序：第 1 → 2 → 3 → 4 → 5

階段一 Q&A 核心問題清單（依情境選 3-5 個）：

• R：你想回答的核心問題是什麼？問題類型是描述性／解釋性／規範性？
• T：打算援引哪些理論？是核心分析框架還是工具性輔助？多個理論是互補、競爭、還是整合？
• M：選擇此方法的理由？由研究問題推導嗎？資料已有還是需蒐集？
• C：要與哪個文獻對話、填補什麼缺口（理論／方法／實證）？主張強度是探索性框架、初步理論建構、還是假說驗證？
• S：在當前研究組合中的位置（依 portfolio-status.md）？有無時序衝突？目標期刊是否匹配貢獻強度？

方向 D2｜反向工作流

章節推進順序：第 3 → 4 → 2 → 5 → 1

階段一 Q&A 核心問題清單（依情境選 3-6 個）：

• M（詳細）：用了什麼方法？樣本規模、時間範圍、抽樣方式？變項如何操作化？統計分析方法與分析單位？
• 結果（反向專屬）：主要發現？哪些假設被支持／不被支持？哪些結果意外或超越既有文獻？效果量／解釋力多強？
• T：這些結果可與什麼理論對話？意外結果可推進哪些理論邊界？是否挑戰主流理論？
• R（倒推）：從結果倒推可回答的核心問題？哪種陳述最能突顯結果價值？是否需聚焦？
• C：貢獻定位？與哪個文獻直接對話？實務意涵？

反向工作流特別提醒：誠實論述方法論軌跡（不得將倒推包裝成「初始即確立的理論框架」，對齊 writing-standards.md）；避免「過度理論化」（難解釋的結果保留為邊界條件，不硬套理論）。

方向 D3｜計畫書工作流

章節推進順序：研究緣起 → 目的與問題 → 文獻 → 方法 → 預期結果

階段一 Q&A 核心問題清單（依情境選 4-6 個）：

• 缺口：目前文獻的研究缺口？為何重要？是理論／方法／實證缺口？實務層面是否有對應問題？
• R：基於缺口，核心研究問題與子問題？可操作性（計畫書審查關鍵）？
• T：擬援引理論框架？與缺口的對話關係？理論掌握度（工具性援引需聲明深化計畫）？
• M：擬採用方法？為何能回答研究問題？可行性（資料可得性、經費、時程）？
• C：預期理論／實務貢獻？發表規劃（幾篇、哪些期刊）？對使用者學術發展的影響？

計畫書工作流特別提醒：文獻探討以確立缺口為目的（較短）；預期結果要誠實（過度承諾結案受挫）；時程保留 buffer（質性訪談困難、量化樣本招募困難）。

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第四部分｜paper-structure.md 模板（使用說明 + 引用）

模板正文已外移：完整模板正文置於 references/paper-structure-template.md，建構 paper-structure.md 時依下方使用說明套用該檔。

模板使用說明

• 不同研究類型（質性 / 量化 / 理論框架 / 計畫書）使用同一核心模板，在對應節標記 [適用] / [簡化] / [N/A]
• 量化或理論框架的欄位，質性研究可選擇 [N/A] 標記保留或直接刪除
• 模糊處一律標記 ⚠️ 待確認，同一行簡短說明需要釐清什麼
• 「文獻分析完成清單」欄位 canonical 定義見 references/paper-structure-template.md「文獻分析完成清單」表（單一權威，本檔不重述；literature-analysis 回寫時對齊 paper-structure.md 既有 schema，見第六部分合約）

模板外的配套輸出

輸出一：首席參謀戰略評估（不寫入 paper-structure.md）

每次階段一執行完後，在對話層輸出 + 存檔 05_輸出/戰略評估_paper-structure_[日期].md：

## 首席參謀戰略評估

**目標吻合度**：
[與使用者中長期研究目標的關係、與使用者研究定位（依 about-me.md／research-identity.md）的吻合度]

**資源競爭提醒**：
[研究組合中的時序衝突或精力分配問題，依 portfolio-status.md 當前組合]

**時程建議**：
[依發表節奏，建議啟動 / 推進時機]

**需要注意的風險**：
[方法設計風險、期刊選擇風險、理論框架成熟度風險、「待確認」項目的影響]

**反方論證與 frame-lock 風險**（對抗檢核產出，見 references/adversarial-and-commitment.md C）：
[核心 RQ 反方論證／貢獻定位反方論證／frame-lock 風險等級＋說明／建議處置]

輸出二：Mode B 修訂紀錄

Mode B 修訂時，不在 paper-structure.md 內附加修訂紀錄段落，改為在 progress-log.md 新增一條：

## YYYY-MM-DD 第 X 次協作｜research-design-diagnosis Mode B 修訂

**觸發原因**：[什麼讓使用者回來修訂]
**修訂範圍**：
- [維度 / 章節 / 節]：[原來] → [修訂後]
**尚待確認**：[仍模糊、需後續釐清]

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第五部分｜重複調用機制

research-design-diagnosis 不是一次性啟動，而是在以下情境重複被調用：

1. 啟動新章節的節層級建構時：「幫我展開第 3 章到節層級」
2. 啟動小節層級建構時：「幫我展開 2.1 節到小節層級」
3. Mode B 修訂：「3.4 節的方法論論述結構需要重新檢視」
4. chapter-drafting 寫作發現結構不夠時：「第 2.2 節寫作時發現論述邏輯不清楚，需要回 research-design-diagnosis 補強」

重複調用時的執行原則：

• 只針對當前任務層級執行，不重新跑整個 RTMCS；但修訂涉及核心 RQ 或貢獻定位時，該決策點的 commitment gate 與對抗檢核仍須觸發（僅針對該點）
• paper-structure.md 的更新採「局部更新」，不覆寫整個檔案；且所有修訂（含階段二、三的累積更新）一律先產出於 05_輸出/ 修訂版，經使用者確認後才正式採用，不就地改動唯讀區正本
• 在 progress-log.md 記錄每次調用（統一位於當前專案 05_輸出/progress-log.md，S-0 狀態留痕入口：啟動回讀、變更即追加），包含調用目的、推進內容、下一步、commitment gate 開關狀態（若使用者曾說「跳過表態」）

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第六部分｜與下游 Skills 的介面合約

research-design-diagnosis 產出的 paper-structure.md 達到特定層次時，觸發下游 Skills 的啟動條件：

paper-structure.md 狀態	可啟動的 Skill	啟動時 Skill 需讀的內容
第 2 章某節達小節層級	literature-search（文獻搜尋）	該節核心任務、論述順序、關鍵文獻清單、經典白名單
literature-search 完成（_metadata.json 已產出，且 pending_zotero_transfer.md 的「PDF 已晉升至 vault」欄已勾選）	literature-analysis（逐篇文獻分析）	單篇 PDF + metadata 條目
literature-analysis 某節完成	literature-synthesis（跨文件綜整）	該節所有 literature-analysis 分析檔
literature-synthesis 某節完成	chapter-drafting（章節撰寫）	綜整檔 + argument-bank + writing-standards
其他章節達小節層級	chapter-drafting（章節撰寫）	該章完整建構 + 對應資源

此合約在每個章節的「此章可啟動的 Skills」欄位標記明示。

新增合約條文：文獻分析完成清單的回寫

literature-analysis 每完成一篇單篇分析後，回寫 paper-structure.md 的「文獻分析完成清單」新增一列。欄位 canonical 定義以 references/paper-structure-template.md「文獻分析完成清單」表為單一權威——本 skill 與 literature-analysis 均對齊該範本，不各自重述欄位以免 schema 漂移；literature-analysis 實際回寫時以目標 paper-structure.md 的既有 schema 為準（見其「文獻分析完成清單回寫」節的對齊規則與 fallback）。此清單是 literature-synthesis 啟動時確認「哪些文獻已備分析、可調用」的單一真實來源。

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第七部分｜自我檢核清單（輸出前確認，≤12 項）

格式：[x] 項目 —— 是/否，簡短說明。標「不適用」者註明階段。

[ ] 已讀必讀脈絡檔（about-me / portfolio-status / research-identity / folder-instructions（若存在））—— 是/否
[ ] 正確識別 Mode A/B、任務類型（期刊/計畫書/混合）、工作方向（前向/反向/計畫書）—— 是/否
[ ] 本次建構階段與推進的章節層級已明確記錄於對話 —— 是/否
[ ] 模糊處已標記「⚠️ 待確認」並說明需釐清什麼 —— 是/否
[ ] 方法類型標記正確（質性/量化/理論框架）—— 是/否
[ ] （階段一）RTMCS 五維全涵蓋 + 首席參謀戰略評估已輸出並存檔 —— 是/否/不適用
[ ] （階段一）commitment gate 已於決策點執行或經使用者關閉；對抗檢核已跑且「反方論證與 frame-lock 風險」欄已填 —— 是/否/不適用
[ ] （階段二/三）每節有核心任務/字數/要點；每小節有核心論點/論證邏輯/論述順序 —— 是/否/不適用
[ ] （階段三，第 2 章小節）已主動推薦該節關鍵文獻並協助填入 paper-structure.md 白名單，使用者已確認 —— 是/否/不適用
[ ] 「此章可啟動的 Skills」介面合約標記完成（含 PDF 到位條件）—— 是/否/不適用
[ ] （Mode B）progress-log.md 已記錄修訂軌跡且保留原決策理由 —— 是/否/不適用
[ ] 已提醒下一步，並提示範本（example-research-design-diagnosis.md）對齊或建立 —— 是/否

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第八部分｜範本優先原則

範本存在時：格式、語調、深度以範本為基準；規格與流程衝突時以 SKILL 條文為準。範本不存在時依 SKILL 產出，並建議完成後留存為範本。

首次建立範本的時機

首次完整走完三階段建構並產出完整 paper-structure.md 後，建議保留一份代表性案例為 00_專案控制/example-research-design-diagnosis.md（依實際走過的工作方向命名，如「反向工作流範本」）。未來走過其他工作方向（如前向）後，可另存對應範本（命名：example-research-design-diagnosis-前向.md，與既有範本並存）。

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第九部分｜檔尾簽名

每次執行結束時的產出結尾必簽（通用欄位：執行 skill 與版本、執行模式、日期、下一步建議 1–3 條；以下含本 skill 專屬欄位）：

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**檔尾簽名**：
- 執行 Skill：research-design-diagnosis [現行版，見檔尾版本區]
- 執行模式：Mode [A / B]
- 任務類型：[期刊論文 / 研究計畫書 / 混合]
- 工作方向：[前向 / 反向 / 計畫書 / 混合]
- 本次推進：[階段一章層級 / 階段二第 X 章節層級 / 階段三第 X 章 X.X 節小節層級]
- RTMCS 檢核狀態：[R✅ T⚠️待確認 M✅ C✅ S✅]
- 日期：YYYY-MM-DD
- 下一步建議（1–3 條）：
  1. …
- 範本對齊：[已讀取 example-research-design-diagnosis.md / 尚無範本]
- 對抗檢核／commitment gate：[已執行 / commitment gate 經使用者關閉 / 不適用]
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版本歷史：v1.1.2｜必讀清單補 writing-standards（選讀）；補控制檔模板出處。v1.1.1｜版本對齊重打包（無內容變更）。v1.1.0｜新增無工作區模式（claude.ai 等無持久檔案系統的環境）降級分支。v1.0.1｜紅隊審查修訂。